文献解读
Nat Commun顶刊成果!!!辣椒CaKAN3-CaHSF8“差异结合”,,破解HTHH胁迫下“耐热-免疫”协调难题
在全球气候变化背景下,,高温高湿(HTHH)已成为制约农业生产的关键复合胁迫因子,,,,它既会直接引发植物热损伤,,,又会削弱免疫系统增加病原菌侵染风险,,,,而植物如何在这种贴近田间实际的胁迫下协调 “耐热” 与 “免疫” 两大核心反应,,其分子机制长期未明。。。今天和大家分享一篇关于聚焦辣椒抗逆机制研究的文章,,,,该文章于2023年7月发表在nature communications杂志上,,,标题为“Differential CaKAN3-CaHSF8 associations underlie distinct immune and heat responses under high temperature and high humidity conditions”。。。
01. 研究思路
该研究针对高温高湿(HTHH)下茄科作物“耐热 - 免疫”协调机制空白的问题展开:先从辣椒“HTHH +青枯菌”处理的RNA-seq数据中,,,,筛选出仅在HTHH相关条件下上调、、定位于细胞核的CaKAN3(原涉发育)与CaHSF8(原涉耐热)。。。通过VIGS沉默与烟草过表达实验,,,证实二者均为HTHH下抗青枯菌免疫的正调控因子,,,仅 CaHSF8参与极端高温耐热。。。再用IP-MS、、、BiFC、、、、MST、、、CoIP 等技术解析互作机制,,证实两者在HTHH早期(1-3h)或中温(31-37℃)下于细胞核内依赖CaHSF8的 HR-A/B结构域与CaKAN3全长互作,,,,HTHH后期(6h)或极端高温(45℃)下互作消失,,,,且免疫调控需二者协同、、耐热中CaHSF8可独立作用。。。经ChIP-seq及验证,,,,二者共激活6个含特定基序的NLR免疫靶基因,,,,CaHSF8单独激活4个HSP耐热靶基因。。。最终构建模型:HTHH早期有病原菌时,,,,二者互作激活 NLR启动免疫;后期无病原菌或极端高温时,,互作解离,,CaHSF8单独激活HSP启动耐热,,,首次揭示转录因子“差异结合”介导的抗逆调控机制。。
02. 主要研究内容
(1)CaKAN3 与 CaHSF8 相互作用
为筛选潜在调控蛋白,,尊龙时凯以“经28℃、、90%湿度或37℃、、、、90%湿度条件下青枯菌(RSI)处理的CaKAN3-GFP瞬时过表达辣椒叶片”为材料,,提取CaKAN3-GFP蛋白进行IP-MS分析;结果显示,,,在37℃、、、90%湿度+RSI条件下,,共获得10个高置信度的CaKAN3潜在互作蛋白。。。。经 BiFC 实验初步验证筛选出CaHSF8,,后续通过MST实验、、、、Pull-down 实验及CoIP实验进一步验证。。所有数据证实CaKAN3与CaHSF8存在互作,,,且BiFC实验显示二者互作发生于细胞核内。。。通过构建3 个CaHSF8缺失突变体与 1 个CaKAN3缺失突变体,,,,结合Pull-down实验分析互作必需结构域,,,,结果显示 CaHSF8缺失突变体D3与CaKAN3均不互作,,CaKAN3缺失突变体CaKAN3myb与 CaHSF8也不互作,,,表明CaHSF8的HR-A/B结构域及CaKAN3全长是二者互作的必需条件。。。
(2)用ChIP测序法测定CaKAN3和CaHSF8的DNA结合位点
为探究作用模式,,尊龙时凯以“37℃、、、90%湿度+青枯菌(RSI)处理的CaKAN3或CaHSF8 过表达辣椒叶片”为材料提取染色质,,通过ChIP-seq确定二者DNA结合位点:CaKAN3有10661个高置信度结合位点(关联717个基因),,,CaHSF8有36473个(关联2337个基因,,p<0.05);二者超89%结合峰位于远端基因间区,,仅7-8%在靶基因启动子区。。。比较发现199个重叠结合峰,,,,富集于植物-病原菌互作等通路。。利用 DREME/MEME软件,,,鉴定出CaKAN3保守结合序列AACAA、、、、CaHSF8保守结合序列 TTCTAGAA;EMSA实验显示,,,CaKAN3-GST可结合3×AACAA,,,,突变序列3×AAAAA 无结合,,且3×AACAA驱动的GUS活性在37℃、、、、90%湿度下因CaKAN3-HA过表达增强,,,,28℃、、90%湿度下减弱。。同理,,CaHSF8可结合TTCTAGAA,,其过表达在两种温湿度下均增强3×HSE驱动的GUS活性,,表明二者分别通过AACAA、、、HSE调控靶基因。。酵母单杂交实验显示,,CaHSF8(及阳性对照CabZIP6369)有转录活性,,,,CaKAN3无转录活性。。。
(3)CaHSF8 以温度依赖性方式与 CaKAN3 发生差异结合,,,,从而协同激活高湿高温(HTHH)特异性免疫反应与耐热性
通过BiFC、、、、Nluc/Cluc 实验发现:二者在28℃、、、、34℃、、、37℃处理1h及37℃处理1-3h互作,,37℃6h及45℃各时间点均无互作,,MST、、CoIP验证与之一致,,,证实HTHH早期二者特异性互作。。。与28℃、、90%湿度(RTHH)相比,,,,45℃或37℃3h后CaHSF8对6个NLR基因的激活受抑,,而4个HSP基因在45℃或37℃长期处理下上调,,,,且CaHSF8过表达在HTHH/RSHT下1-6h均上调HSP基因。。此外,,,,CaHSF8在28℃、、、37℃可结合NLR启动子,,,,45℃不可,,,却在37℃6h及45℃各时间点结合HSP启动子;CaKAN3在三种温湿度下均结合NLR启动子,,,结合亲和力无显著时间差异。。。。以上表明,,CaHSF8通过温度依赖性差异结合CaKAN3,,,,分别激活高温特异性免疫与耐热性。。。。
03. 参考文献
Yang S, Cai W, Wu R, et al. Differential CaKAN3-CaHSF8 associations underlie distinct immune and heat responses under high temperature and high humidity conditions. nature communications. 2023 Jul 25;14:4477. doi: